Créer un environnement de développement#

  • Poetry

  • flake9

  • selenium

  • pytest

Sous Linux#

Sous Windows#

Dans une VM séparée#

Exemple avec AlmaLinux9. Avec Ubuntu, les commandes pour installer les paquests « de base » sont un peu différentes, mais presque tout le reste est sans doute identique.

  • mettre à jour le système

    dnf update dnf clean all

  • Installer dans la VM les packages de base indispensables : - tar (n’est pas toujours installé) - git - python311 - python3.11-devel - python3-pip (utilisé par vscode) - postgresql-server - libpq-devel (utilisé pour construire le pilote psycopg2) - group « development tools » - nginx

Note

Pour l’instant, il faut au moins python 3.10 mais on devrait pouvoir travailler avec python3.9 au besoin…

  • créer l’utilisateur qui gèrera l’instance (dans la suite, on utilisera l’utilisateur biomaid):

    adduser biomaid

    usermod -G nginx -a

  • Donner les droits au groupe “nginx” d’accéder en lecture à /home/biomaid/ et /home/biomaid/staticfiles/

  • Créer un fichier “simple-biomaid.conf” dans /etc/nginx/conf.d et y insérer :

server {
  server_name simple_biomaid;

  location /static {
    alias /home/biomaid/staticfiles/;
  }

  location / {
        proxy_set_header        Host $http_host;
        proxy_set_header        X-Real-IP $remote_addr;
        proxy_set_header        X-Forwarded-For $proxy_add_x_forwarded_for;
        proxy_set_header        X-Forwarded-Proto $scheme;
        add_header P3P 'CP=""';

        proxy_pass http://unix:/home/biomaid/biomaid.sock;
  }
}

  • initialiser le gestionnaire de bases de données

    # postgresql-setup initdb # systemctl start postgresql # systemctl enable postgresql # sudo -i -u postgres

    $ createuser –interactive Enter name of role to add: biomaid_user Shall the new role be a superuser? (y/n) n Shall the new role be allowed to create databases? (y/n) y Shall the new role be allowed to create more new roles? (y/n) n

    $ psql

    postgres=# postgres=# alter role biomaid_user with password “biomaid_pwd”;

  • configuration des accès à postgresql :

    # cd /var/lib/pgsql/data # nano pg_hba.conf

    mettre “md5” comme méthode d’identification sur le port local en IPv4

  • ouverture des ports de firewalld :

    # firewall-cmd –zone=public –add-port=8000/tcp –permanent # firewall-cmd –zone=public –add-service=http –permanent # firewall-cmd –reload

  • désactiver SELinux

    # nano /etc/selinux/config

    mettre “disabled” au lieu de “enforcing” dans SELINUX=

  • se connecter comme biomaid

  • créer le dossier qui accueillera les logs :

    $ mkdir log

  • Créer la BDD

    $ createdb -h localhost -U biomaid_user biomaid_db

  • cloner biomaid dans le dossier home de biomaid

  • installer Poetry

    $ curl -sSL https://install.python-poetry.org | python3 -

  • aller dans le dossier du projet biomaid et installer les dépendances :

    $ cd biomaid $ poetry install –no-root

  • local:

    $ ln -sf local_biomaid local

  • instance configuration

    $ cp mktests_instance_settings.py instance_settings.py $ nano instance_settings.py

    mettre les bonnes infos dans la connexion BDD ajouter l’IP de la VM choisir DEBUG=True pour commencer

  • migration initiale :

    $ poetry shell $ python manage.py migrate

  • revenir comme root

  • activer le démon nginx :

    # systemctl enable –now nginx

  • Créer le fichier de service suivant dans /etc/systemd/system/